En cada auditoría interna, tienen acceso al sistema PAI el auditor interno, el subauditor interno y un funcionario designado por el auditor interno como digitador. Para ello, deben haber sido incluidos mediante la remisión del formulario respectivo al Centro de Operaciones de la CGR. Estos usuarios sólo podrán ver la información de su propia institución y de su auditoría interna, así como los planes de ésta.

En la CGR, tienen acceso al sistema los gerentes y los asistentes técnicos de las áreas de fiscalización, y uno o dos funcionarios designados por el gerente de área como enlaces. En este caso, las personas indicadas pueden ver (pero no modificar) la información relacionada con las instituciones, auditorías internas y planes de auditoría de las entidades que fiscaliza el área respectiva. Además, tienen acceso el titular de la Gerencia de la DFOE y el administrador del sistema en la Secretaría Técnica de la DFOE.